为《暗芝居》系列制作团队推出的新作「纸芝居」动画，由喜爱怪兽的创作者们创造出原创怪兽，以昭和怀旧的画风呈现，并且每只怪兽都会配合一首主题歌曲进行介绍。 故事舞台为性格丰富们的怪兽突出然出现在世界各地，集结各方智慧以监视、分析怪兽的组织「国连怪兽监视团」，摸索如何让拥有强大力量的怪兽可与人类共同生存。
住在踯躅台的高中1年级生响裕太，某天醒来后失去了记忆。 之后，裕太与旧电脑里显现出来的“Hyper Agent·古立特”相遇了。 古立特告诉裕太“去完成使命”，而裕太则开始寻找这番话的意义以及自己的记忆。 虽然对这一突发事件感到困惑，裕太仍然在同班同学内海将以及宝多六花、新条茜等人的帮助下过着每一天。 然而，平稳的日常被突然现身的怪兽轻易地踏碎——。
“我被冥界拉黑了，所以死不了。”因为某种原因，他被冥界禁止入内，无法回归冥界。为了回到冥界，他开始将幽灵拥有的“灯火”收集到自己的灯笼里。这个神秘的“自称仙人”——鼹鼠（百暗桃弓木），行踪诡异。据说，遇到他的人会开始看见一些奇怪的事物……
七濑武（宫野真守 配音）是一名看似十分淡漠，内心里也却是冷若冰霜的少年。曾经不堪回首的往事让他选择封闭自己的内心，不透露出丝毫的感情。虽然一直克制着自己的情绪，但七濑武又时时能够感受到内心里还在燃烧的火焰。一次偶然中，七濑武在校园里遇见了一名昏倒在地上的少女，善良的七濑武将少女带到了保健室，得知她名叫相羽六（东山奈央 配音）。 让七濑武没有想到的是，他和相羽六的相遇彻底改变了自己的人生轨迹。相羽六在误打误撞之中将七濑武变为了魔法使。之后，七濑武的青梅竹马五十岛胡桃（濑户麻沙美 配音）、同班同学伊田一三（铃村健一 配音）和保健老师兵头七海等人纷纷拥有了能够使用魔法阵的能力。
由于家人的缘故，姬小路秋人（逢坂良太 配音）和姬小路秋子（木户衣吹 配音）这对从小就分离的兄妹即将重新同住一间屋檐下，令以写禁断小说为生的秋人意想不到的是，自己的妹妹，曾经天真可爱的秋子如今居然成为了一个兄控！果然，倡导“兄妹之间的爱才是珍贵的纯洁感情”的秋子对秋人发起了猛烈的攻击。 在秋人的身边还聚集了一群姿色可人的美少女，这让秋子感到如临大敌。扎着金色双马尾，总是莫名其妙的就说起了H话题的傲娇娘那须原安娜（茅原实里 配音）；表面柔弱内心腹黑的猿渡银兵卫春臣（下田麻美 配音）；个性火爆但十分可靠的二阶堂岚（喜多村英梨 配音），她们的存在为秋人本来就很混乱的生活火上浇油。而总是用血缘关系拒绝秋子的秋人隐藏了一个惊天秘密——他和秋子之间，其实并无血缘关系。
这是，某个冬日的故事。 女高中生抚子刚从静冈搬家到山梨，为了观赏“绘制在千元纸币上的”富士山，骑着自行车来到本栖湖。但不巧天气是阴天，没能看到富士山，抚子累得当场躺下睡着了。当她醒过来的时候，时间已是深夜。在第一次到达的地方，早已忘记了回家的路途。一个爱好露营的女孩子凛，向不安胆怯的抚子伸出了援手。为了温暖冻僵的身体，两人点燃了篝火。噼啪噼啪的柴火爆音，在静寂的湖畔显得沁人心脾。围着篝火，抚子和凛一边捧着咖喱面一边对话。终于，两人期盼已久的瞬间到来了。 “看到了……富士山……” 抚子与凛，由两人的相遇而衍生的户外系girls story开始了。
突然出现在人类面前的神秘飞翔体“灾”。 意味着灾厄的此一存在凭借异样的战斗力凌驾于所有的航空战力之上。 为对抗他们而开发的，便是对现有机体进行特别调整以实现超水准高机动力， 被称为“子体”的兵器。 负责操控的则是名为“阿尼玛”的操纵机构。它——竟拥有少女的外表。 因“灾”的缘故而失去驾驶员母亲的少年“鸣谷慧”， 他遇见了闪耀鲜红光辉的瑞典制战斗机以及驾驶它的阿尼玛“格里芬”。 身为人类最终兵器却动作不稳定的格里芬，还有一心向往天空的少年， 两人漫长且炙热的故事就此展开。
《黑礁第二季》承接了第一季《黑礁》的故事内容，于2006年10月2日 - 12月18日在日本播出。
在东西分裂的伦敦所展开的，少女们的谍战动作剧！ 舞台是19世纪末，被巨大的墙壁东西分断的阿尔比恩王国的首都伦敦。 在传统与礼仪的名门梅菲尔女王校，有5位少女在此就学。 她们以女高中生为伪装，展开间谍活动。 化装、谍报、潜入、驱车追逐……。 少女们活用各自的能力，在影之世界来回飞奔。 “我们是什么？” “间谍。是满口谎言的生物”
科技发达的机械化理想国度，帝国。驱使超自然力量·星灵术，作为“魔女之国”受人畏惧的涅比利斯皇厅。两国的漫长战争仍在持续。 帝国最强战力伊思卡和别名“冰祸魔女”的皇厅公主爱丽丝莉洁在激战中逐渐了解对方的真心，被对方的人生理念和理想所吸引，成为了劲敌。 二人在独立国家阿尔萨米拉粉碎了帝国和皇厅的阴谋，约定改日再见后，走上了各自的道路，却以意外的形式实现了约定。 伊思卡和爱丽丝的妹妹希丝蓓尔达成交易，作为她的护卫潜入了皇厅。爱丽丝为了寻找希丝蓓尔，来到了皇厅的都市里斯伯登。 偶然的重逢让二人的内心燃烧得更加激烈，然而与此同时，帝国的间谍“纯血种·受试体E”在皇厅内部暗中活跃，帝国的“特殊任务·女王捕获计划”即将启动。 伊思卡和爱丽丝的关系面临撕裂，他们究竟能否对抗这一命运。
小维（广桥凉 配音）是一名标准的“电波少女”，表面上，她常常面无表情、一动不动，似乎无论这个世界发生了什么都跟她没有任何关系，但在内心里，有些孤独的小维还是希望能够得到他人的关心和友谊。 一次偶然中，一位名叫银仙（小野大辅 配音）的狐仙来到了小维的身边，由于担心小维的生活和健康状态，善良的银仙主动留在了小维身边，陪伴并照顾着她。之后，表面腹黑内心忠诚的狗神（樱井孝宏 配音）、放荡不羁的信乐（中田让治 配音）、傲娇的小玉（野上尤加奈 配音）接二连三的出现在了小维的面前，有了这些古怪但善良的朋友们陪伴，小维的生活中会发生怎样有趣的故事呢？
